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FlowJo(细胞分析专业软件) 7.6.5 中文版

FlowJo(细胞分析专业软件) 7.6.5 中文版 免费

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应用介绍


    FlowJo(细胞分析专业软件) 7.6.5 中文版免费目春意披荆斩棘盎然不转睛5. 缘分是可遇不可求的,但是,如果缘分来到我们身边,我们却不去珍惜的话,那我们将不会再得到。缘分来临的时候,它给了我们一瞬间触电般的感觉,缘分尽了的时候,它让我们久久不能释怀。因此,放下已经失去的,珍惜此刻拥有的,才是最重要的。52. Chinese knots stand for friendship, love and good luck.(2013.全国)395.红军不怕远征难,万水千山只等闲。《七律?长征》

    FlowJo是一款流式细胞分析专业软件,可以兼容几乎所有流式仪器采集的数据,FlowJo简单易用,功能强大,帮助用户轻松了解了解细胞的状态变化, 拥有流动室和液流驱动系统,光电转换器和数据处理系统等先进的科学技术!
    
    功能介绍
    1.单标样本
    单标记样本数据常用的显示方式是单参数直方图。通常横坐标可以是线性标度或对数标度,代表着所检测的荧光或散射光的强度;纵坐标表示的是横坐标某一特定荧光强度的细胞数,有时也用相对百分比来表现。
    以3 color comp 文件夹中的CyPE comp.fcs进行分析演示。将此文件夹移至桌面,并把该数据文件夹从桌面拖入Flowjo中的组空间中。
    
    软件截图2
    在组空间中单击选中“3 color comp”组,此时在样本空间里显示“3 color comp”组中的所有样本。而后在样本空间中双击“Cy5PE comp.fcs”,出现图形窗口。
    
    软件截图3
    此为二维点图,X轴选择SSC(侧向散射,细胞内颗粒结构越复杂,质量越大,SSC越大,反之越小。)Y轴选择FSC(前向散射,细胞越大,FSC越大;反之越小。)
    选择设门工具(矩形门、椭圆门、多边形门、自动门)中的任意一个,在二维点图中选中淋巴细胞。
    
    软件截图4
    在图形窗口中双击选中的淋巴细胞,生成新的图形窗口。在X轴选择Cy5PE:CD4,Y轴选择Histogram,选择设门工具(区域门、双分门)中任意一个,在单参数直方图中设门。
    
    软件截图5
    2.多色标样本
    多色标记样本,包含双标记、三标记及以上的样本。横坐标和纵坐标分别代表与细胞有关的两个独立参数,平面上的每一个点表示具有相应坐标值的细胞。
    以三标记样本为例,选择3-color-experiment文件夹中的931115-B02-Sample01.FCS进行分析演示。同样,在在样本空间中双击“931115-B02-Sample01.FCS”样本,出现图形窗口,显示为二维点图。X轴选择FSC,Y轴选择SSC。然后选择多边形设门工具,在二维点图中选中淋巴细胞。
    
    软件截图6
    双击淋巴细胞门,出现图形窗口,X轴选择Fluor::CD3,Y轴选择FSC。使用矩形设门工具选中CD3阳性细胞,设门并命名为T细胞。
    
    软件截图7
    双击T细胞门,出现图形窗口,在X轴选择Cy5PE::CD4,Y轴选择PhyEry::CD8,使用十字门工具设门(拖动鼠标将四分门移到目标位置即可,一般根据细胞分群的趋势,四分门的界定线可设在阴性、阳性细胞的分群处),如下图所示:
    Q1:CD8单阳性细胞,为CD8+ T细胞
    Q2:双阳性细胞
    Q3:CD4单阳性细胞,为CD4+ T细胞
    Q4:双阴性细胞
    
    软件截图8
    3.细胞凋亡(Cell apoptosis)
    拖入凋亡样本,双击原始数据打开图形窗口。X轴选择FSC-A,Y轴选择SSC-A。分析凋亡的细胞选择上图所示的细胞群体进行分析。细胞碎片不予分析。
    
    软件截图9
    在SSC/FSC图中双击“分析的细胞群体”,X轴选择FITC,用来表示AnnexinV-FITC。Y轴选择PE-Texas,用来表示PI。用四分门设门工具界定活细胞和凋亡细胞。如下图所示:
    Q1:(AnnexinV-FITC)-/PI+,此区域的细胞为坏死细胞。也可能有少数的晚期凋亡细胞在其中,甚至机械损伤的细胞也包含其中。
    Q2: (AnnexinV+FITC)+/PI+,此区域的细胞为晚期凋亡细胞。
    Q3:(AnnexinV-FITC)+/PI-,此区域的细胞为早期凋亡细胞。
    Q4:(AnnexinV-FITC)-/PI-,此区域的细胞为活细胞。
    通常统计细胞凋亡率时采用Q2+Q3,晚期凋亡+早期凋亡群(即所有AnnexinV阳性群)。
    
    软件截图10
    4.细胞周期(Cell Cycle)
    细胞周期的检测是流式细胞仪最为广泛的应用之一。细胞周期是指以有丝分裂方式增殖的细胞从亲代14. 妈妈是最漂亮的,爸爸是最帅的,我是最可爱的,所以我要抓住时间,改造世界,让生活变得更加美好!分裂结束到子细胞分裂结束所经历的过程。通常由G1期、S期、G2期和M期组成。细胞在G1期完成必要的生长和物质准备,在S期完成染色体DNA的复制,在G2期进行必要的检查和修复,以保证DNA复制的准确性。在M期完成遗传到子细胞中的均等分配,使细胞进行分裂。
    细胞周期检测中PI最为常用。PI为插入性核酸荧光染料,能选择性的嵌入核酸DNA和RNA双链螺旋的碱基之间与之结合,其结合的量与DNA的含量成正比例关系,用流式细胞仪进行分析,就可以得到细胞周期各个阶段的DNA分布状态,从而计算出各个期的百分含量。
    以cell cycle 文件夹中的5206.001,PI标记为例,设门选取目标细胞群体,将细胞碎片排除在外。即双击工作台中的5206.001样本,打开图形窗口。X轴选择FSC-H,Y轴选择SSC-H,细胞碎片位于左下角的位置,设门选中目标细胞,如下图:
    
    软件截图11
    设门选中要进行细胞周期分析的单细胞群体,排除粘连细胞(粘连在一起的双细胞或多细胞团块等)的影响。X轴选择FL2-W(width),Y轴选择FL2-A(area),设门方式如下图:
    
    软件截图12
    BD的流式仪采集的数据:在进行周期分析的时候,通常是采用FL2-A与FL2-W(或者FL2-A与FL2H)进行设门。
    Beckman的流式仪采集的数据:X轴选择FL3-LIN,用来表示PI的线性信号。Y轴选择FL3-PEAK,用来表示PI的峰值信号。设门方式如下图:
    
    软件截图13
    在FlowJo工作台中选中“单细胞群体”这个节点,在菜单栏的“工具”中选择“细胞周期”,打开周期分析窗口。得到G1期、S期、G2期细胞百分比,G1期CV值和G2期CV值等数据。
    
    软件截图14
    图中粉色的曲线是周期拟合的模型曲线,黑色的为样本曲线。理想状况是粉色和黑色曲线吻合一致为最佳。拟合的好坏可以根据右边的RMS值来判断。RMS(root mean square error)值越小越好,当周期拟合的不好的时候,可以通过更换拟合模型(Watson和Dean-Jett-Fox)或者更改限制条件确保(G1是G2的两倍)进行调整。
    而G1/S/G2百分比:G1/S/G2期细胞所占的百分比。G1/G2均数:G1/G2期细胞荧光强度的平均数。CV(Coefficient of Variation,变异系数):仪器因素和样品制备及染色过程对标本的人为影响。通常G0/G1峰的CV来检测分辨率或精度。G1 cv/G2 cv:G1/G2峰的变异系数,其大小反映了G1/G2峰的宽度,数值越小,峰越窄。
    FlowJo 处理流式数据简单易学,而且TOP10 免疫学期刊上的文章大多数都是用 FlowJo 分析数据。使用好FlowJo对发高分文章会有很大的帮助。
    
    御街行 晏几道排空驭气奔如电,升天入地求之遍。FlowJo(细胞分析专业软件),FlowJo(细胞分析专业软件)下载,其他行业,行业软件Someone who looks around or down appears shifty (不可靠的)to Americans, although in fact one doesn’t stare continuously at the other person, but glances elsewhere every few seconds.

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